Akadémiai forrástár a COVID-19 ellenes küzdelemhez

A koronavírussal kapcsolatos vészhelyzet folyamatos éberséget kíván mindannyiunktól, így a Magyar Tudományos Akadémia Köztestületétől is. Lovász László elnök 2020. március 13-án felhívással fordult az osztályelnökökhöz, kérve, hogy közöljék, ha tudomásuk van olyan új tudományos eredményről, amely hatékonyan bevethető a COVID-19-pandémia megfékezésére. Az MTA ezzel az akciójával a döntéshozók segítségére kíván lenni anélkül, hogy bármilyen párhuzamos intézkedéssel megzavarná a hatósági tájékoztatást. Az akció átmeneti jellegű, kizárólag a vészhelyzet idejére korlátozódik.

2020. március 17.

Az osztályoktól érkezett jelentések két csoportra oszthatók. Az első csoportban olyan új tudományos eredményekről szóló beszámolók találhatók, amelyekre a figyelemfelhívás az MTA társadalmi szerepvállalásából adódóan közvetlen akadémiai kompetencia. Ezek segíthetik a döntéshozókat a hatékony politikai lépések gyors meghozatalában. Ilyen volt 2020. március 13-án az iskolabezárások kérdése (ezzel kapcsolatos cikkek is találhatók a forrástárban) vagy a március 16–18. közötti napokban a vírus kimutatását célzó tesztek szenzitivitásának, gyakorlati alkalmazásának kérdése (ezzel kapcsolatos referátumok olvashatók Falus András válogatásában). A forrástár el kívánja kerülni, hogy kezelhetetlen cikkhalmazzá váljon, ezért kizárólag a releváns, új ismeretekre fókuszál: a cikkek elérhetőségét tartalmazza a részletek kibontása nélkül, viszont törekszik arra, hogy a hivatkozásokat tematikusan csoportosítsa.

Az osztályokhoz érkező jelentések második csoportja a járványügy multiszektoriális kezelésének folyamatába bevonható javaslatokat, akcióterveket, szakemberek által felkínált segítséget tartalmaz.

Mindkét csoport azt a célt szolgálja, hogy az Akadémia jelezze készségét a járvány megfékezésére tett erőfeszítésekhez való hozzájárulásra, a társadalmi feladatköréhez tartozó feladatok ellátására. Az Akadémia vezetése ezt a készségét jelzi a döntéshozóknak, igény esetén kész a közreműködésre.

COVID-19-fertőzés lefolyásának elemzése – klinikai tanulmányok

High-flow nasal-oxygenation-assisted fibreoptic tracheal intubation in critically ill patients with COVID-19 pneumonia: a prospective randomised controlled trial
https://bjanaesthesia.org/article/S0007-0912(20)30135-5/fulltext
A közlemény a szokatlanul súlyos lefolyású COVID-19 pneumónia során alkalmazható intubálás hatékonyságát és biztonságosságát elemzi 60 kínai páciens kórtörténetének elemzésével.

Clinical Manifestations of Children with COVID-19: a Systematic Review
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.01.20049833v1
Clinical manifestations of children with COVID-19 differ widely from adults cases.

A Combination Therapy that Eliminates the COVID-19 Virus
https://medium.com/@ngough_bioserendipity/a-combination-therapy-that-eliminates-the-covid-19-virus-4e4c6e3864af

Regisztrált COVID-19-hez kapcsolódó klinikai vizsgálatok
http://apps.who.int/trialsearch/AdvSearch.aspx?SearchTermStat=117&ReturnUrlel%3

Epidemiológia

Susceptibility of ferrets, cats, dogs, and different domestic animals to SARS-coronavirus-2
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.30.015347v1

A Magyar Orvosi Kamara összefoglalója a lakossági maszkviselés szakmai javaslatairól

https://mok.hu/koronavirus/allasfoglalasok/tegyunk-valamit-a-szank-es-az-orrunk-ele?fbclid=IwAR34yUA9QtjTuaGvJMFmF79Tc61DAwRgczMgCia_c6lXOEb2M6qDmyNExqc

Physical interventions to interrupt or reduce the spread of respiratory viruses. Part 1 - Face masks, eye protection and person distancing: systematic review and meta-analysis
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.30.20047217v1

Estimating the number of infections and the impact of nonpharmaceutical interventions on COVID-19 in 11 European countries
https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/sph/ide/gida-fellowships/Imperial-College-COVID19-Europe-estimates-and-NPI-impact-30-03-2020.pdf
The study, published by the Imperial College COVID-19 Response Team on 30 March, estimates the effects that non-pharmaceutical interventions, which also include closing schools and banning of mass gatherings, are having on controlling the spread of the virus across parts of Europe, including Italy, Spain and the United Kingdom. The authors measure the effects by a change in the virus' effective reproduction number.

A Simple Mathematical Model for Estimating the Inflection Points of COVID-19 Outbreaks
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.25.20043893v1

Public Health Responses to COVID-19 Outbreaks on Cruise Ships — Worldwide, February–March 2020
https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/69/wr/mm6912e3.htm?s_cid=mm6912e3_w
Három tengerjáró hajón több mint 800 utólag laboratóriumban igazolt COVID-19 eset vált ismertté, és az Egyesült Államokban számos további hajóúthoz kapcsolódó esetet jelentettek. Mind a személyzet tagjai, mind az utasok érintettek. Eddig tíz, tengerjáró hajókkal kapcsolatos halálesetet jelentettek. Az USA járványügyi központja (CDC) közleményben foglalta össze a közegészségügyi gyakorlatot érintő tapasztalatokat és tanulságokat. A COVID-19 világjárvány ideje alatt minden tengerjáró utazást el kell halasztani. A tapasztalatok hasznosíthatók más, valamilyen speciális okból zárt közösségek védelmére és prevenciójára is.

Vokó Zoltán összeállítása:

A koronavírus-járványra vonatkozó epidemiológiai adatok hasznos forrásai:

Outbreak in the Republic of Korea from January 19 to March 2, 2020.
J Korean Med Sci. 2020 Mar 16;35(10):e112. doi: 10.3346/jkms.2020.35.e112.
Report on the Epidemiological Features of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)
A dél-koreai járvány fontos tanulságokkal szolgál Az 51 millió lakosú országban március 1-ig több mint 95 000 tesztet végeztek (az első behurcolt eset január 19-én érkezett Dél-Koreába). A járvány terjedésével az egyre nagyobb számú kontaktok azonosítása már nehezen kivitelezhető, így egyedül a lakosság személyes kontaktusainak radikális csökkentésével lehet gátat szabni a terjedésnek. A megfelelő ellátással sikerült alacsony szinten tartani a mortalitást, március 2-ig 4212 igazolt eset közül 22-en haltak meg (0.5%). Az 50 év alattiak körében ez az arány 0,2%, 50 év felett 1,2%.

Sun Z et al:
Potential Factors Influencing Repeated SARS Outbreaks in China. Int J Environ Res Public Health. 2020 Mar 3;17(5). pii: E1633. doi: 10.3390/ijerph17051633.
A járvány deskriptív epidemiológiája mellett a jövőbeni kitörések megelőzése érdekében fontos annak vizsgálata, megismerése, hogy melyek a visszatérő SARS járványok okai Kínában. Ugyan a két SARS járványt okozó vírus eredete ma még pontosan nem ismert, vannak olyan közös vonásaik, amelyek segítséget jelenthetnek az újabb kitörések megelőzésében. A szerzők foglalkoznak a vírus állatról emberre terjedésével is.

Hellewell J et al: Centre for the Mathematical Modelling of Infectious Diseases COVID-19 Working Group.
Feasibility of controlling COVID-19 outbreaks by isolation of cases and contacts. Lancet Glob Health. 2020 Feb 28. pii: S2214-109X(20)30074-7. doi: 10.1016/S2214-109X(20)30074-7.
A matematika epidemiológia modellek rendkívül fontosak a járványügyi intézkedések megtervezéséhez és monitorozásához. Az esetek és a kontaktjaik izolálásának és a járvány egyéb epidemiológiai jellemzőinek függvényében a közlemény becsli a járványmegfékezés sikerességének esélyét. A COVID-19 járvány jellemzőiről gyűlő epidemiológiai adatokat matematikai modellbe helyezve látható, hogy önmagában az esetek és a kontaktok izolációja révén a járványt csak nagyon hatékony kontaktfelderítés esetén lehetett volna kontrollálni.

Rothan HA, Byrareddy SN.
The epidemiology and pathogenesis of coronavirus disease (COVID-19) outbreak.
J Autoimmun. 2020 Feb 26:102433. doi: 10.1016/j.jaut.2020.102433
A koronavírus betegség tünettanának, patogenezisének, kezelésének, a SARS-CoV2 vírus filogenezisének, a fertőzés átviteli módjának és a jövőbeni járványok megelőzési lehetőségeinek világos, rövid összefoglalója.

Korábbi cikkek:

Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2004973?query=featured_home

Impact of non-pharmaceutical interventions (NPIs) to reduce COVID19 mortality and healthcare demand
https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/sph/ide/gida-fellowships/Imperial-College-COVID19-NPI-modelling-16-03-2020.pdf
A 2020. március 16-án megjelent közlemény bemutatja: a vakcina hiányában, ismereteink jelenlegi szintjén mi a leghatékonyabb a mód a betegség megjelenésének és a halálozásnak a megakadályozására.

Qifang Bi et al., Epidemiology and Transmission of COVID-19 in Shenzhen China: Analysis of 391 cases and 1,286 of their close contacts, medRxiv.

  1. Chinazzi et al., The effect of travel restrictions on the spread of the 2019 novel coronavirus (COVID-19) outbreak, Science, 2020. 03. 06. (A cikk eredményeit közérthetőbb formában közli a New York Times.)

Specialty guides for patient management during the coronavirus pandemic

Clinical guide for the management of surgical patients during the coronavirus pandemic 16 March 2020 Version 1
https://www.england.nhs.uk/coronavirus/wp-content/uploads/sites/52/2020/03/specialty-guide-surgery-and-coronavirus-v1-16-march-2020.pdf
Az NHS rövid összefoglalója a koronavírus-járvány idején sebészi ellátásra kerülők kezelési elveiről, Prof. Dr. Harsányi László kommentárjával:

Kiemelten fontos a felesleges felvételek, illetve fekvőbeteg-ellátási tartamok kerülése, mert kapacitásokat köt le, illetve a „nozokomiális” fertőződés esélyét fokozza. A nem feltétlenül szükséges sebészi-osztályos felvételeket kompetens döntéshozói jelenlét, illetve a lehetséges nem-sebészi kezelési mód mérlegelése segítheti elő: felelős döntéshozó csak szakorvos (ún. „lead consultant”) lehet, míg utóbbi döntési helyzetre példaként hozható az akut, szövődménymentes kolecisztitisz, aminek jelenleg elsődleges kezelése a korai (laparoszkópos) kolecisztektómia, ám nem szakmai hiba a konzervatív kezelés (AB+tüneti ellátás) választása sem.
A feltétlen műtéti kezelésre szorulók lehetőség szerint „egynapos”/day-case ellátást kapjanak.
Bizonyítottan vírusfertőzött, sürgős műtétre szoruló betegek ellátását aneszteziológiai koordinálású munkacsoport tervezze meg: pl. az erre a célra elkülönített műtőhelység anyaggal-szakemberrel való feltöltöttsége elsődleges a felesleges kontaktusterhelés megelőzése érdekében.
Várható, hogy a perioperatív ellátásba kényszerűen nem-sebészi alapképzettségűeket is be kell vonni: műtéti asszisztencia vagy műtét utáni ellátás/ápolás gyakorlatlan résztvevői kapjanak a szokásosnál részletesebb, sz.e. írásos feladatmeghatározást.
A pandémia ideje alatt a fenti szemléletű sebészi ellátás azért is fontos, mert a járvány-ellátás első vonalában dolgozó, túlterhelt egészségügyi szakszemélyzet védelmét is szolgálja.

Terápiás kísérletek

Treatment of 5 Critically Ill Patients With COVID-19 With Convalescent Plasma
https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2763983

Aminoquinolines Against Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): Chloroquine or Hydroxychloroquine

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0924857920300959?via%3Dihub

A SARS-CoV-2-Human Protein-Protein Interaction Map Reveals Drug Targets and Potential Drug-Repurposing
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.22.002386v1

Lancement d’un essai clinique européen contre le Covid-19
https://presse.inserm.fr/lancement-dun-essai-clinique-europeen-contre-le-covid-19/38737/

A járvány társadalmi kezelésének nemzetközi tapasztalatairól

Coronavirus: The Hammer and the Dance - What the Next 18 Months Can Look Like, if Leaders Buy Us Time
https://medium.com/@tomaspueyo/coronavirus-the-hammer-and-the-dance-be9337092b56
A cikk több ország járványügyi adatállományát elemzi a döntéshozó szervezetek előrelátó politikájának támogatására a várható egészségügyi, gazdasági, társadalmi veszélyek kezelésében.

Ugyanebben a témakörben egy másik összeállítás:
Understanding what works: How some countries are beating back the coronavirus

https://www.statnews.com/2020/03/20/understanding-what-works-how-some-countries-are-beating-back-the-coronavirus/?utm_source=STAT+Newsletters&utm_campaign=ca6789fd00-Daily_Recap&utm_medium=email&utm_term=0_8cab1d7961-ca6789fd00-151086885

Vírushordozás tesztelése – szűrési módszerek szenzitivitása

Általános információk a COVID-19 diagnosztikájára vonatkozóan

FACT SHEET FOR HEALTHCARE PROVIDERS
https://www.fda.gov/media/135662/download
Kommunikációs leírás egészségügyi dolgozók számára, világosan és röviden.

Wang W et al.
Detection of SARS-CoV-2 in Different Types of Clinical Specimens.
JAMA. March, 2020. DOI:10.1001/jama.2020.3786.
Fontos gyakorlati jelentősége van annak, hogy 205 pácienstől vett különféle minta (zömében orr-garat váladék, de több esetben vér és széklet) vizsgálata nem adott minden esetben egybehangzó pozitivitást: 6 esetben vagy csak az orr-garatban, vagy csak a székletben (!) volt kimutatható a vírus. Ez egyben az is jelenti, hogy a járvány széklettel is terjedhet.

Oxford scientists develop rapid testing technology for COVID-19
http://www.ox.ac.uk/news/2020-03-18-oxford-scientists-develop-rapid-testing-technology-covid-19

The critical role of laboratory medicine during coronavirus disease 2019 (COVID-19) and other viral outbreaks
https://www.degruyter.com/downloadpdf/j/cclm.ahead-of-print/cclm-2020-0240/cclm-2020-0240.pdf

Reagensek, tesztek

COVID-19 Reagents
https://www.bio-connect.nl/covid-19-reagents/cnt/page/6570

Coronavirus Primers
https://www.biobasic.com/coronavirus-covid-19-primers
A mellékelt közlemény a COVID-19 kimutatására alkalmas nukleotid primereket sorolja fel. Ez arra utal, hogy az RT PCR teszt hozzáférhető nyilvános információk alapján.

2019-nCoV CDC-qualified Probe and Primer Kits for SARS-CoV-2
https://www.biosearchtech.com/products/pcr-kits-and-reagens/pathogen-detection/2019-ncov-cdc-probe-and-primer-kit-for-sars-cov-2
Egy kereskedelmi cég (BioSearchTechnologies) már a CDC (Centers for Disease Control and Prevention) által validált nukleotid primereket használja a COVID19 tesztekhez.

TaqPath™ COVID-19 Combo Kit
https://www.fda.gov/media/136112/download
Az AppliedBiosystem Combo kitje, részletes leírással.

Klinikum

WHO to launch multinational trial to jumpstart search for coronavirus drugs
https://www.statnews.com/2020/03/18/who-to-launch-multinational-trial-to-jumpstart-search-for-coronavirus-drugs/?utm_source=STAT+Newsletters&utm_campaign=8359943ee6-MR_COPY_01&utm_medium=email&utm_term=0_8cab1d7961-8359943ee6-151086885

A COVID-19-ről szóló tudományos cikkek folyamatosan frissülő gyűjteménye

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/coronavirus/