Atommagkutató Intézet
Atom- és Molekulafizikai Laboratórium
Felületfizikai kutatócsoport

Bölcsészettudományi Kutatóközpont
Filozófiai Intézet
Irodalomtudományi Intézet
Moravcsik Gyula Intézet
Művészettörténeti Intézet
Néprajztudományi Intézet
Régészeti Intézet
Történettudományi Intézet
Zenetudományi Intézet

Földfizikai és Űrtudományi Kutatóintézet

HUN-REN Agrártudományi Kutatóközpont
Állatorvos-tudományi Intézet
Julianna majori telephely
Mezőgazdasági Intézet
Növényvédelmi Intézet
Talajtani Intézet

HUN-REN Csillagászati és Földtudományi Kutatóközpont
Földrajztudományi Intézet
Földtani és Geokémiai Intézet
Geodéziai és Geofizikai Intézet
Konkoly Thege Miklós Csillagászati Intézet

HUN-REN Energiatudományi Kutatóközpont
Atomenergia-kutató Intézet
Energia- és Környezetbiztonsági Intézet
Műszaki Fizikai és Anyagtudományi Intézet

HUN-REN Nyelvtudományi Kutatóközpont
Általános és Magyar Nyelvészeti Intézet
Lexikológiai Intézet
Nyelvtechnológiai és Alkalmazott Nyelvészeti Intézet
Történeti Nyelvészeti és Uralisztikai Intézet

HUN-REN Rényi Alfréd Matematikai Kutatóintézet
Geometria Osztály
Gráfelmélet Osztály

HUN-REN SZBK
Biofizikai Intézet
Biokémiai Intézet
Genetikai Intézet
Központi Laboratóriumok
Növénybiológiai Intézet

Kísérleti Orvostudományi Kutatóintézet
Humán Agyszövet Laboratórium
Transzlációs Magatartás Idegtudomány Kutatócsoport

Közgazdaság- és Regionális Tudományi Kutatóközpont
Közgazdaság-tudományi Intézet
Regionális Kutatások Intézete
Világgazdasági Intézet

Ökológiai Kutatóközpont
Evolúciótudományi Intézet
Ökológiai és Botanikai Intézet
Vízi Ökológiai Intézet

Számítástechnikai és Automatizálási Kutatóintézet

Természettudományi Kutatóközpont
Anyag- és Környezetkémiai Intézet
Enzimológiai Intézet
Kognitív Idegtudományi és Pszichológiai Intézet
Metabolikus Gyógyszer-kölcsönhatások Kutatócsoport
Szerves Kémiai Intézet

Wigner Fizikai Kutatóközpont
Komputációs Tudományok Osztálya
Részecske- és Magfizikai Intézet
Számítógép Hálózati Központ
Szilárdtest-fizikai és Optikai Intézet
Wigner Adatközpont